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技術(shù)文章

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  • 抗體條形碼eCLIP:快速、微量、高通量的蛋白質(zhì)-RNA檢測(cè)技術(shù)

    RNA和蛋白質(zhì)相互作用研究主要通過紫外交聯(lián)和免疫沉淀(CLIP)技術(shù),但即便是目前最新的增強(qiáng)型CLIP(eCLIP)技術(shù),在改進(jìn)了RNA片段文庫制備方法的基礎(chǔ)上,也需要4天的時(shí)間才能完成一次實(shí)驗(yàn),而且缺乏并行處理多個(gè)RNA結(jié)合蛋白(RBP)的能力。2022年12月22日,來自加州大學(xué)圣地亞哥分校的GeneW.Yeo和KarenB.Chapman研究組合作在NatureMethods上以BriefCommunication形式發(fā)表了題為Multiplexedtranscript...

    20245-16
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  • Cell Reports Methods:報(bào)告基因檢測(cè)細(xì)胞間蛋白交換

    細(xì)胞通訊(intercellularcommunication)是多細(xì)胞生物維持穩(wěn)態(tài)的重要組成部分,在腫瘤發(fā)生、衰老、感染性疾病中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。細(xì)胞通訊通常分為依賴接觸的直接通訊和以可溶性因子和細(xì)胞外囊泡(extracellularvesicle,EV)的交換為基礎(chǔ)的間接通訊。目前,研究細(xì)胞通訊有一個(gè)關(guān)鍵的難點(diǎn)在于如何區(qū)分逃出核內(nèi)體(endosome)并在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)發(fā)揮功能的蛋白質(zhì)和被溶酶體降解或釋放回細(xì)胞外空間的蛋白質(zhì)。目前缺少有效地監(jiān)測(cè)和量化細(xì)胞通訊間的功能性蛋白質(zhì)交換的...

    20245-16
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  • Nature Biotechnology:同時(shí)檢測(cè)DNA序列信息和表觀修飾修飾

    DNA不僅存儲(chǔ)遺傳序列信息,同時(shí)還有表觀修飾信息,這兩者都對(duì)我們理解生物學(xué)至關(guān)重要。通過高通量測(cè)序測(cè)定DNA堿基G、C、T和A序列的方法已經(jīng)比較成熟,近年來針對(duì)DNA中的表觀遺傳信息的檢測(cè)方法也有了很大的進(jìn)展,比如通過堿基轉(zhuǎn)換的方法區(qū)分未修飾的C與修飾的5-甲基胞嘧啶(5mC)或5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)。這些方法包括基于亞硫酸氫鹽的方法,如全基因組亞硫酸氫鹽測(cè)序(WGBS)和無亞硫酸氫鹽方法,如酶甲基測(cè)序(EM-seq)和TET輔助的吡啶硼烷測(cè)序等。但是目前的DNA測(cè)序方...

    20245-16
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